Web26. dec 2024 · 利用转录组测序技术, 分析转基因花生中 AhPEPC1 基因的抑制表达是否影响其他基因的功能。分析结果显示, 对照花生样品WT中共有17,928个基因表达, 转基因花生样品TL中共有17,839个基因表达, 其中有17,418个基因是WT和TL共同表达的, 有510个基因是WT特有表达, 有421个基因 ... Web8. máj 2024 · Tophat2 conda 直接安装 conda install -c bioconda sra-tools conda install fastqc ## 不知道是网速还是怎么下载中断好几次,所以改为手动安装了 conda install trimmomatic conda install tophat2 conda install bowtie2 conda install samtools conda install cufflinks 有些软件用conda 无法安装,可以尝试手动安装 tophat.png 预编译版本安装
Tophat的安装与使用_augsdihh_新浪博客
Web26. sep 2014 · tophat2: 下载网址:http://ccb.jhu.edu/software/tophat/tutorial.shtml 首先安装好bowtie2 下载地址:http://sourceforge.net/projects/bowtie-bio/files/bowtie2/ 下载(最新版本的) bowtie2-2.2.3-linux-x86_64.zip 解压:unzip bowtie2-2.2.3-linux-x86_64.zip cd bowtie2-2.2.3-linux-x86_64 (由于这个已经是编译好的) Web26. dec 2024 · tophat2+cufflinks转录组测序实例将为你介绍转录组测序也就是最近热门的RNAseq整个流程,有兴趣的小伙伴可以点个关注,一起讨论学习! 人的基因组一共有两万多个基因,但这些基因并不是每时每刻都在表达,在不同时间不同组织中,基因的表达是不同的,而检测这些基因表达的有效方法就是RNAseq,它结合了下一代测序技术来对整个细胞 … fredericks \\u0026 mae playing cards
生信软件 bowtie2(测序序列与参考序列比对)
Web30. júl 2024 · 1 HISAT2官网下载 人类和小鼠的索引有现成的, HISAT2官网 可以直接下载进行序列比对。 如下图所示:选择hg19和mm10的index,文章中RNA-Seq测序数据,可以包括人类和小鼠的数据,因此需要小鼠和人类的索引。 Web转录组测序技术(RNA-seq)是研究基因表达的常用方法,目前已有近百种分析RNA-seq数据的软件。本研究基于相同硬件设备,利用传统Tophat2等软件和新开发HISAT2等软件搭建了两套RNA-seq数据分析平台并进行比较。 Web一:下载安装该软件 其实一般的生信服务器自然会有高手给安装好了,你只需调用即可,这里我给大家演示一下如何安装。 wget … blinding snow aqw